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张雍也是载入宋史的名臣，他果然应诺，如实向朝廷奏报了陈世卿在守城中的表现。朝廷表彰陈世卿的功绩，升他为执梓州掌书记，正六品，为掌管一路军政、民政机关的机要秘书。在此期间，他一边向朝廷要求减轻茶农赋税，一边大力开发农田水利，为战乱后的四川民心得以稳定下来，并重新建设家园，为此，他还专门写了一首“劝农”的诗歌：
“奉诏叮咛劝尔农，各安田里莫欺公；
人心若与天心合，天意还与人意同。
稼穑艰难须着力，世途平易总为功；
郊原雨过民情喜，共赏时和与岁丰。”
在宋朝有一个制度，凡进士出身在地方官，做满三年，经过考核，没有什么劣绩，就可以献上自己的文章或诗赋，请求调到中央各馆、阁任职。但陈世卿关心民间疾苦，无意于当一名文字粉饰太平的馆阁闲职。结果，这一干就是七年，梓州一路政通人和，百业俱兴，基本回到了战乱前的景象。
咸平五年（1002），陈世卿政绩优异，被召回朝廷，在中央部门任秘书郎，即皇家图书馆馆长，后迁任太常中丞，即礼乐部副部长。这一年陈世卿日子过得非常优闲，无论是秘书郎还是太常中丞，都不是朝廷重要机关，政务也不繁忙，因此有闲情逸致写下了不少诗。
咸平六年（1003），陈世卿的好友张鉴出任广州知州，推荐陈世卿为广州通判。朝廷认为陈世卿也该休息得够了，便应允了。临上任前，皇帝召见了陈世卿，赐他绯袍，加封为太常博士。
通判乃知州副职，相当于现在的常务副市长，辅佐知州处理政务，凡兵民、钱谷、户口、赋役、狱讼等分事，须通判连署方能生效，在地方是一人之下，万人之上。
当年四月，陈世卿来到广州，这是他第二次到广东任职，前一次是衡州。在这里，他再一次了解了市舶司的作用，然后还没干半年，朝廷就下调令了，因为他升官了。
景德元年（1004年），陈世卿调任福建建州知州，正五品，宋朝的封疆大史，家乡的父母官。
回到家乡，陈世卿心潮澎湃，特意在公务之余，回贡川老家看望自己的老母亲，尔后在祖祠思古堂设宴款待兄弟族人。
此时陈世卿已经52岁了，看着又一批批新生的陈氏后代，看着才华横溢的儿子孙子们，他非常欣慰，离别的时候，他赋诗《思古堂饯别》以训告族人多读书：
“思古堂前酒一樽，共谈时事出孤村。
临期上马无他嘱，多买诗书教子孙。”
宋真宗十分器重陈世卿的才干，数月后又升陈世卿为福建转运使负责南剑州（今福建南平）安仁等银矿的开采。安仁各处银矿在陈世卿的有效管理下，年产量增产许多。因此，陈世卿受到朝廷嘉奖，不久出任两浙路转运使。
大中祥符四年（1011），世卿出任荆湖北路转运使，正四品高官。这次出使，是皇帝特意安排的。当时荆湖北路四州不断被少数民族侵扰，派兵数年无法剿平。皇帝知陈世卿文武双全，他说：“朕知卿上马能平乱，下马能安民，文武双全，期尔平之，勿负联望。”
“臣必效死命！”陈世卿虽然已经年近六十岁，仍然豪气不减当年。
湖南澧州慈利县位于张家界市西北部，地处武陵山脉东部边缘，澧水中游，是一个“七山半水分半田，一分道路和庄园”的山区，民族杂居，各民族为了争夺地盘常常发生磨擦。
这一年又有“下溪等四州蛮人侵县境地四百余里”。朝廷命陈世卿与阁门祗候史方、知澧州刘仁霸共同领兵讨伐。陈世卿知道对民族间的矛盾不能简单地用武力镇压，要晓之以理，动之以情。他花了两年时间，耐心做各民族头人的工作，因利势导，化解民族矛盾，使各族间逐渐消除隔阂，重新丈量地界，心悦口服地退回侵占的地盘，放回掠虏的一千多名汉人。
看到奏报后，宋真宗对大臣们称赞陈世卿说：“兵不血刃，就使对方还土地，放回生民，一路欢呼，家家喜庆。应该用玉音礼乐褒奖，使天下的人都知道。”
中祥符六年（1013），陈世卿母亲病逝，陈世卿回乡守孝。
中祥符九年（1016），陈世卿守孝三年，重新进京，在回京叙职后，一群朋友为他举办迎接宴会，他当庭赋诗一首：
“翠竹峰前是我家，归来重整旧生涯；
烟霞尚有留人日，争奈门前驰马车。”
这首诗表达了家乡虽好，但也难留他的报国之心的心情。他回到京城，正逢广州知州邵晔病危，朝廷授陈世卿为秘书少监、加赐金印紫授，出任广州知州。
广州秦汉时就是繁荣都会，汉唐以来是海上“丝绸之路”的始发港。971年，宋军刚攻克广州，太祖赵匡胤便下旨立即建立市舶管理机构，《宋史》载：“克广州，擒刘鋹，即日诏与潘美同知广州，兼市舶转运使。”
在北宋时期，意大利旅行家鄂多立克说广州已经比当时世界著名商贸城市威尼斯大三倍。市舶收入是宋王朝财政收入的一项重要来源。北宋中期，市舶收入达四十二万缗左右。
陈世卿是第三次来到广州，第一次是在广州的邻居衡州任推官，第二次是来广州担任通判，这次则是来广州任知州，即相当于广东省省长。他与广州注定有缘。
上任伊始，陈世卿就带着一干漕使和广州市舶司的官员们来市舶司的港口码头迎接一个重要商人，作为广州知州，同时他还兼着市舶司转运使。
这是一个风平浪静的下午，人报以广州富商“瓷老刘”为纲首的巨型海舶出海历时一年，即将返航驶入广州港。
看着瓷老刘的巨舶缓缓驶近岸边，陈世卿立即带着那些衣着光鲜的大官们在向他们招手。巨舶靠岸了，按照老规矩，瓷老刘们先不上岸，而由知州、漕使等先上船。
尽管陈世卿地位很高，相当于省长还兼着市舶司的第一把手市舶使的职务。虽然船上只是一些商人，但在当时，大笔的海外贸易，大宗的舶来品，会牵动国家的经济，绝不是小事。
“瓷老刘啊，辛苦啦！”陈世卿首先向他们拱手慰问。
“知州大人，在下给你们请安啦！”全船一片欢呼。
瓷老刘奉上了货物清单，陈世卿略一浏览，就命人下舱验货去了。看过货物以后，就要决定关税征收事宜。宋代没有关于市舶制度的统一、完整的规定，市舶司的职责主要包括：根据商人所申报的货物、船上人员及要去的地点，发给公凭(公据﹑公验)，即出海许可证；派人上船“点检”，防止夹带兵器、铜钱、女口、逃亡军人等；“阅实”回港船舶；
对进出口的货物实行抽分制度，即将货物分成粗细两色，官府按一定比例抽取若干份，这实际上是一种实物形式的市舶税；所抽货物要解赴都城(抽解)‘按规定价格收买船舶运来的某些货物(博买)；经过抽分、抽解、博买后所剩的货物仍要按市舶司的标准，发给公凭，才许运销他处。
办理完税务之后，陈世卿又问瓷老刘以及其它商人：“有什么困难，需要本官给你们解决的，尽管说来。”
瓷老刘和众商人互看一会儿，站出来说：“广州限制食盐供应，按人口买盐的制度，对我等商人以及广州老百姓非常不方便。”
陈世卿连连点头，他上任后，也有许多百姓反应这个问题。于是，他回到知州衙门，起草奏折，向朝廷上疏请求废除这一制度，放开食盐供应。同时，上奏朝廷说，外国运来的货物一律免税是不对的。外国来贡礼品的人数，大食、三佛等不过是20人左右；占城、丹麦等也不过是15人左右，而大多数外国商人来华都是从事商业贸易活动，都应该照章纳税。
这其实是宋朝的朝贡制度的弊端，因为朝廷为了保持天朝大国的面子，对蕃国朝贡使节给予免税，但这样一来，那些蕃国商人立即打着朝贡的幌子，表面朝贡，献上些华而不实的礼品给皇帝后，私下里却利用免税制度做起生意，有些商人为了谋求暴利甚至冒充使节，假造个国书就敢进京献贡。
当时，广州通东南亚有３条固定的贸易航线：从广州到阇婆国，顺风一月可到；从广州到三佛齐，“泛海便风二十日”；从广州到占城，顺风八日。今越南南部的占城，在宋代取代交州成为印度支那的国际贸易中心，各国商人云集。961年至1174年，占城遣使来华足有60次之多。
商人以使节身份来往频繁，甚至冒充使节，使国家损失了大量关税，陈世卿早在担任衡州推官时就听说这个事情，后来在太常寺为官时，了解了朝贡体系，就更发现其中的弊端，现在来广州当封疆大吏，自然对此事不能不管。
朝廷经过一番争论，最后还是比较务实地接受了陈世卿的观点，批准了陈世卿的请求，从此，广州财政税收大增，促进了地方经济的繁荣。
在陈世卿担任广州虽然仅仅不到一年，但却为广州革除了两个弊政，深受百姓爱戴。
中祥符九年（1016）底，陈世卿由于水土不服，在广州任所病逝。
